Говоря о природе Башкирии, нельзя обойти вниманием пещеры. На территории Башкирии их около 1000. Среди них и крупнейшая пещера Урала – Киндерлинская амплитудой 215 метров и протяженностью более 13 километров, и всемирно известная палеолитической живописью пещера Шульганташ (Капова).